weterynarz lublin czuby

Wyliczyliśmy współczynniki korelacji Pearsona dla stransformowanych logicznie starych / młodych wskaźników wszystkich genów w analizowanych typach tkanek. Zgodnie z oczekiwaniami, stwierdziliśmy wysoką korelację między ekspresją p16INK4a i Arf (r = 0,75, P <0,0001) i niewielką korelacją między Arf i p21CIP (r = 0,37, P = 0,03), ale brak istotnej korelacji między p16INK4a i p21CIP. Wyniki te są zgodne ze znanymi związkami transkrypcyjnymi tych genów; w szczególności zidentyfikowano kilka białek (43. 47), które koordynują regulację ekspresji obu produktów Ink4a / Arf, a Arf reguluje aktywność p53, co z kolei indukuje ekspresję p21CIP. Nieoczekiwanie odkryliśmy wysoką korelację pomiędzy p18INK4c i p19INK4d (r = 0,68, P = 0,002), co sugeruje, że te geny są regulowane przez wspólne lub pokrewne elementy transkrypcyjne. Chociaż te homologiczne INK4 są jednocześnie eksprymowane w wielu tkankach (18), nie jesteśmy świadomi poprzednich danych pokazujących skoordynowaną ekspresję in vivo. Następnie rozważono ekspresję regulatorów Ink4a / Arf (Suplementowa Figura 3). Stwierdzono słabą ujemną korelację między ekspresją Id1 i p16INK4a (r = y 0,40, P = 0,07), zgodną z znaną funkcją Id1 (3 jako represor transkrypcji p16INK4a (40, 42). Nie zaobserwowano znaczącej korelacji między ekspresją Bmi-1 a ekspresją p16INK4a lub Arf (nie pokazano). Zadziwiająco jednak stwierdzono silną korelację pomiędzy p16INK4a i Ets-1 (r = 0,62, P <0,001, Figura 4A), ale nie między Arf i Ets-1 (r = 0,15, P = 0,40). Ta obserwacja jest zgodna ze stwierdzeniem, że Ets-1 indukuje ekspresję p16INK4a, ale nie Arf, w hodowanych komórkach (40, 41) i sugeruje, że znaczący składnik wariancji in vivo w ekspresji p16 INK4a z wiekiem (r2 = 0,38) wyniki aktywacji transkrypcyjnej przez Ets-1 (Figura 4B). Co więcej, zaobserwowano zmniejszenie ekspresji Ets-1 w nerkach szczurów CR i myszy (Figura 3D), co sugeruje, że zwiększony metabolizm występuje przed aktywacją Ets-1 w nerce starzejącej się. Podobnie, silna korelacja między p16INK4a i Arf sugeruje również, że nieznany coregulator (y) p16INK4a i Arf wywiera potężny efekt (r2 = 0.49) na ekspresję obu produktów Ink4a / Arf wraz z wiekiem i że ten koregulator (ów) musi być niezależny od Ets-1 (ponieważ Arf i Ets-1 nie są skorelowane). Zatem wydaje się, że ekspresja p16 INK4a in vivo w procesie starzenia odzwierciedla prawie równie specyficzny efekt p16 INK4a, który koreluje z ekspresją Ets-1, i niezależny efekt korygujący Ink4a / Arf. Figura 4p16INK4a wyrażająca starzenie się silnie koreluje z ekspresją Arf i Ets-1. (A) Wykres punktowy (skala log2, obie osie) stosunków (stary / młody) ekspresji p16 INK4a w porównaniu ze stosunkiem ekspresji (stary / młody) Arf, Ets-1 i Id1 widziane w odpowiedniej tkance (n = 22. 70 par danych na gen z maksymalnie 15 tkanek myszy i szczura). Każdy stosunek reprezentuje średnią wartość wielu pomiarów na tkankę, jak opisano w Metodach. Linia najlepszego dopasowania określona za pomocą regresji liniowej jest pokazana dla każdej serii danych, z współczynnikiem korelacji Pearsona i 2-ogonową wartością P. Nie zaobserwowano znaczącej korelacji między Arf i Ets-1 lub między Arf lub p16INK4a i Bmi-1 (nie pokazano). (B) Strzałki pokazują znane lub wnioskowane zależności transkrypcyjne, a liczby wskazują kowariancje (r2) dla połączonych elementów, jak określono w A. Ponieważ p16INK4a i Arf nie regulują się nawzajem, wydaje się rozsądne założenie, że nieznany Coregulator (X) moduluje ekspresję obu transkryptów wraz z wiekiem, wyjaśniając ich silną korelację (r2 = 48%). Ponadto, ponieważ Arf i Ets-1 nie są kowariancyjnymi, X i Ets-1 muszą być niezależne [przypisy: młody zielony jęczmień gdzie kupić, mielopatia, misy tybetańskie ]